久久精品无码鲁网中文,国产色无码精品视频国产,国产在线一区二区视频,亚洲综合色区另类小说

業(yè)務(wù)熱線:

027-86925668

腫瘤免疫細胞浸潤分析

組學(xué)測序

腫瘤免疫細胞浸潤分析

分析目的

越來越多的證據(jù)表明,腫瘤微環(huán)境(免疫細胞浸潤)在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展中起著重要作用,并且還可以影響患者的預(yù)后。腫瘤免疫微環(huán)境是揭示腫瘤及亞型異質(zhì)性和患者不同預(yù)后和治療反應(yīng)的重要因素。


數(shù)據(jù)來源

自測數(shù)據(jù)或公共數(shù)據(jù)庫里的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。


分析方法
通過分析腫瘤樣品的免疫和基質(zhì)評分以檢測差異表達基因,篩選腫瘤微環(huán)境中的關(guān)鍵預(yù)后基因,并構(gòu)建了腫瘤微環(huán)境相關(guān)的預(yù)后模型。首先,從TCGA數(shù)據(jù)庫獲得了腫瘤患者的mRNA-Seq和相關(guān)臨床信息,并使用ESTIMATE算法計算了腫瘤組織的基質(zhì)和免疫評分。然后,進行功能富集分析,并從與腫瘤微環(huán)境高度相關(guān)的差異基因中生成了蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)。最后,對TCGA的腫瘤數(shù)據(jù)集進行Cox比例風(fēng)險回歸分析,并對浸潤的免疫細胞和人類蛋白質(zhì)圖譜進行分析。


分析內(nèi)容
(1)差異表達基因的鑒定、每個樣本的各類免疫細胞組分
(2)腫瘤 vs 對照的免疫細胞組分差異表達分析


分析結(jié)果示例圖

樟树市| 易门县| 呼图壁县| 富锦市| 太谷县| 凤凰县| 台湾省| 张家口市| 芜湖市| 新和县| 赤水市| 西乡县| 忻州市| 成安县| 疏勒县| 巫山县| 昌图县| 临城县| 美姑县| 抚松县| 洪江市| 乌苏市| 屏东市| 迭部县| 山丹县| 渭南市| 章丘市| 博湖县| 阿克| 菏泽市| 长汀县| 东平县| 西乌| 乾安县| 阳信县| 利津县| 梁山县| 琼海市| 武穴市| 微山县| 咸丰县|