宏病毒組(Virome)測序又稱病毒宏基因組(Viral Metagenome)測序,是通過高通量測序技術對環(huán)境中所有病毒的遺傳物質(zhì)(RNA或DNA)進行分析,揭示病毒組成、群體結構等特征,在病毒發(fā)現(xiàn)和溯源、微生物預警等領域具有重要作用。它克服了傳統(tǒng)微生物分離和培養(yǎng)的技術限制。該技術通過提取樣本中的總核酸進行測序,能夠揭示樣本中的病毒的組成、基因功能和代謝通路等遺傳多樣性和分子生態(tài)信息。
產(chǎn)品特點
無偏性測序:宏病毒高通量測序技術不依賴于特定的微生物培養(yǎng),能夠直接對樣本中的所有核酸進行測序,這使得它在檢測未知或難以培養(yǎng)的病原微生物時具有獨特優(yōu)勢。
全面性:該技術能夠檢測樣本中的病毒、細菌、真菌、寄生蟲及非經(jīng)典微生物等,提供全面的微生物組成分析。
高通量:利用高通量測序平臺,如NovaSeq PE150和PacBio RSII,能夠產(chǎn)生大量的測序數(shù)據(jù),提供更深入的微生物群落分析。
技術多樣性:宏病毒高通量測序包括二代和三代技術,二代技術提供10G raw data,而三代技術提供3G raw data,根據(jù)不同的研究需求選擇合適的技術平臺。
準確性和分辨率:三代測序技術在保持長讀長的同時兼顧了準確度,減少了拼接錯誤,提高了基因組組裝注釋的準確性和微生物群落鑒定的分辨率。
分析內(nèi)容
結果展示
送樣建議
樣品類型 | 要求 |
水體 | 海水或清澈水體:20 L以上超濾濃縮或FeCL3沉淀后送樣;其他水體類型視水質(zhì)具體情況而定; |
環(huán)境 | 淤泥、土壤、沉積物≥15-30 g;糞便或腸道內(nèi)容物≥15-30 g;組織樣本≥15-30 g;血液樣本≥10 mL(推薦送血清); |
運輸要求:干冰運輸,避免反復凍融 |
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