產(chǎn)品介紹

宏基因組（Metagenomics）是對(duì)特定環(huán)境中的整個(gè)微生物群落進(jìn)行研究的方法。這項(xiàng)技術(shù)突破了傳統(tǒng)微生物分離和培養(yǎng)的技術(shù)限制，直接提取環(huán)境樣本DNA進(jìn)行測(cè)序，研究環(huán)境微生物的群落 結(jié)構(gòu)、物種分類、系統(tǒng)進(jìn)化、基因功能及代謝網(wǎng)絡(luò)等。宏基因組測(cè)序技術(shù)在醫(yī)學(xué)、畜牧、農(nóng)業(yè)、環(huán)境和生物能源等多個(gè)領(lǐng)域都有廣泛的應(yīng)用。

產(chǎn)品特點(diǎn)

全面性：宏基因組測(cè)序能夠提供對(duì)樣本中微生物群落的全面分析，包括物種組成、基因功能和代謝通路等。

高通量：我們采用先進(jìn)的測(cè)序平臺(tái)，選取較好組裝效果，充分挖掘環(huán)境樣品中的微生物菌群和功能基因，提供更深入的微生物群落分析。

技術(shù)多樣性：根據(jù)高通量測(cè)序平臺(tái)的不同，宏基因組測(cè)序可分為二代和三代技術(shù)。二代技術(shù)提供10G raw data，而三代技術(shù)提供3G raw data，根據(jù)不同的研究需求選擇合適的技術(shù)平臺(tái)。

準(zhǔn)確性和分辨率：三代測(cè)序技術(shù)在保持長讀長的同時(shí)也兼顧了準(zhǔn)確度，減少了拼接錯(cuò)誤，提高了基因組組裝注釋的準(zhǔn)確性和微生物群落鑒定的分辨率。

專業(yè)分析：我們擁有專業(yè)的生物信息團(tuán)隊(duì)，可以滿足個(gè)性化的生物信息分析要求。

分析內(nèi)容

1、基本分析結(jié)果
  1.1三代宏基因組組裝與矯正
  1.2宏基因組組分分析（基因預(yù)測(cè)）
  1.3非冗余基因集的構(gòu)建（功能注釋分析）
  1.4功能注釋分析(Nr、Go、KEGG、eggNOG、Pfam、SwissProt、CAZy、CARD、VFDB、PHI-base、CYPED)
2、功能多樣性分析
  2.1功能基因組成及豐度分析Kegg功能基因組成分析eggNOG功能基因組成分析碳水化合物酶組成分析CARD功能基因組成分析
  2.2功能基因的Beta多樣性分析功能基因的PCA分析功能基因的PCoA分析功能基因的NMDS功能基因的UPGMA功能基因的anosim功能基因的permanova
  2.3功能基因的組間差異分析功能基因的組間差異參數(shù)檢驗(yàn)功能基因的組間差異非參數(shù)檢驗(yàn)功能基因的metagenomeSeq
  2.4功能基因的關(guān)聯(lián)及相關(guān)性分析功能基因的相關(guān)性分析RDA/CCA（需要提供環(huán)境因子數(shù)據(jù)）

3、物種多樣性分析
  3.1物種組成及豐度分析物種組成柱狀圖
  3.2物種的Beta多樣性分析物種組成的PCA分析物種組成的PCoA分析物種組成的NMDS分析物種組成的UPGMA分析物種組成的anosim分析物種組成的permanova分析
  3.3物種的組間差異分析物種組成的組間差異參數(shù)檢驗(yàn)物種組成的組間差異非參數(shù)檢驗(yàn)metagenomeSeq分析物種Lefse分析物種隨機(jī)森林分析
  3.4關(guān)聯(lián)及相關(guān)性分析物種相關(guān)性分析RDA/CCA（需要提供環(huán)境因子數(shù)據(jù)）

結(jié)果展示

送樣建議