首頁(yè) > 組學(xué)測(cè)序 > 微生物組 > 宏Hi-C完成圖
Hi-C完成圖測(cè)序則是將Hi-C技術(shù)應(yīng)用于宏基因組領(lǐng)域,用于研究復(fù)雜微生物群落中不同微生物之間以及微生物與宿主之間的三維基因組結(jié)構(gòu)和相互作用。
產(chǎn)品特點(diǎn)
提供三維結(jié)構(gòu)信息:與傳統(tǒng)的宏基因組測(cè)序相比,宏Hi-C完成圖測(cè)序不僅能夠獲得微生物群落中各個(gè)物種的基因組序列信息,還能夠揭示它們?cè)诩?xì)胞內(nèi)的空間位置和相互作用關(guān)系,有助于深入理解微生物群落的結(jié)構(gòu)和功能。
高分辨率:能夠在較高的分辨率下解析基因組的三維結(jié)構(gòu),識(shí)別出較小尺度的染色質(zhì)相互作用,對(duì)于研究基因調(diào)控、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合等具有重要意義。
研究物種間相互作用:可以幫助研究人員了解不同微生物之間以及微生物與宿主之間的相互作用,例如共生關(guān)系、寄生關(guān)系等,為研究微生物群落的生態(tài)功能和進(jìn)化提供新的視角。
挖掘潛在功能基因:通過(guò)分析染色質(zhì)的三維結(jié)構(gòu),可以發(fā)現(xiàn)一些在傳統(tǒng)測(cè)序中難以檢測(cè)到的潛在功能基因和調(diào)控元件,為深入研究微生物的代謝途徑和適應(yīng)性進(jìn)化提供線索。
樣本類型 | 建議送樣量 | 最低送樣量 |
土壤/污泥/沉積物/腐殖質(zhì) | 2g | 1g |
水體濾膜(孔徑0.22-0.45μm/直徑3-4cm) | 3張 | 1張 |
空氣濾膜 | 3張 | 1張 |
拭子 | 5-6個(gè) | 3個(gè) |
瘤胃液/發(fā)酵液/組織液/沖洗液(離心有明顯沉淀) | 3-5mL,沉淀1g | 1mL,沉淀0.5g |
糞便/腸道內(nèi)容物 | 2g(小鼠6-10粒) | 0.5g(小鼠3粒) |
動(dòng)物/人組織 | 1g | 0.5g |
牛奶/酸奶 | 30mL/50g | 10mL/5g |
食糜 | 2g | 1g |
食品表面拭子 | 8個(gè) | 5個(gè) |
保存及運(yùn)輸:樣本-80℃或液氮中長(zhǎng)期保存,干冰運(yùn)輸 |
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