細(xì)菌完成圖是對細(xì)菌全基因組進(jìn)行測序后,經(jīng)過復(fù)雜的拼接和組裝,最終得到的完整基因組序列圖譜。它就像是細(xì)菌的“基因身份證”,全面且精準(zhǔn)地展示了細(xì)菌基因組的全部信息。在微生物學(xué)研究、醫(yī)學(xué)診斷、環(huán)境微生物監(jiān)測以及工業(yè)微生物應(yīng)用等眾多領(lǐng)域,細(xì)菌完成圖都發(fā)揮著關(guān)鍵作用。例如,在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,通過細(xì)菌完成圖可以深入了解致病細(xì)菌的基因組成,為精準(zhǔn)醫(yī)療提供依據(jù),有助于開發(fā)更有效的抗生素和治療方法。
產(chǎn)品特點
采用先進(jìn)的第三代測序技術(shù)(如PacBio或Nanopore測序)與第二代測序技術(shù)(Illumina測序)相結(jié)合的方式。第三代測序技術(shù)能夠讀取較長的DNA片段,減少拼接過程中的錯誤和間隙,而第二代測序技術(shù)可以提供高精度的堿基信息,用于校正第三代測序可能出現(xiàn)的錯誤。這種混合測序策略確保了細(xì)菌完成圖的高度準(zhǔn)確性,堿基錯誤率可控制在極低水平。
細(xì)菌完成圖能夠覆蓋細(xì)菌基因組的全部區(qū)域,包括染色體、質(zhì)粒等。無論是基因富集區(qū)域還是基因間區(qū),都能在完成圖中得到體現(xiàn)。這使得研究人員能夠全面了解細(xì)菌基因組的結(jié)構(gòu)和組成,例如一些位于基因間區(qū)的調(diào)控元件,對于理解基因的表達(dá)調(diào)控機(jī)制至關(guān)重要,而細(xì)菌完成圖可以完整地呈現(xiàn)這些信息。
在完成圖的基礎(chǔ)上,提供豐富的基因注釋內(nèi)容。包括基因的位置、長度、編碼的蛋白質(zhì)序列、基因功能預(yù)測(基于同源比對和功能域分析)、基因所屬的代謝途徑等信息。除了單個細(xì)菌基因組的信息,還可以提供與其他相關(guān)細(xì)菌基因組的比較分析結(jié)果。例如,通過計算基因的同源性、共線性,以及基因組島的差異等指標(biāo)。
(1)非致病性(例:傳染?。?;
(2)對數(shù)期50ml,菌液4000×g離心10min(4°C),棄上清,沉淀用無菌水洗2次后液氮速凍,-80°C保存,干冰送樣;
(3)有明顯主帶,無降解,無RNA、蛋白質(zhì)等雜質(zhì)污染;
(4)細(xì)菌完成圖:DNA總量≥8μg;
真菌精細(xì)圖:DNA總量≥10μg;
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