分子實驗
Co-IP檢測
一、實驗概念
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細胞內(nèi)生理性相互作用的有效方法。其原理是:當細胞在非變性條件下被裂解時,完整細胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來。如果用蛋白質(zhì)X的抗體免疫沉淀X,那么與X在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)Y也能沉淀下來。目前多用精制的prorein A預先結(jié)合固化在argarose的beads上,使之與含有抗原的溶液及抗體反應后,beads上的prorein A就能吸附抗原達到精制的目的。這種方法常用于測定兩種目標蛋白質(zhì)是否在體內(nèi)結(jié)合;也可用于確定一種特定蛋白質(zhì)的新的作用搭檔。
二、實驗流程
預冷PBS,RIPA Buffer,細胞刮子(用保鮮膜包好后,埋冰下),離心機
1. 用預冷的PBS洗滌細胞兩次,最后一次吸干PBS;
2. 加入預冷的RIPA Buffer(1ml/107個細胞、10cm培養(yǎng)皿或150cm2培養(yǎng)瓶,0.5ml/5×106個細胞、6cm培養(yǎng)皿、75cm2培養(yǎng)瓶)
3. 用預冷的細胞刮子將細胞從培養(yǎng)皿或培養(yǎng)瓶上刮下,把懸液轉(zhuǎn)到1.5EP管中,4℃,緩慢晃動15min(EP管插冰上,置水平搖床上)
4. 4℃,14000g離心15min,立即將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中
5. 準備Protein A agarose,用PBS 洗兩遍珠子,然后用PBS配制成50%濃度,建議減掉槍尖部分,避免在涉及瓊脂糖珠的操作中破壞瓊脂糖珠
6. 每1ml總蛋白中加入100μl Protein A瓊脂糖珠(50%),4℃搖晃10min(EP管插冰上,置水平搖床上),以去除非特異性雜蛋白,降低背景
7. 4℃,14000g離心15min,將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中,去除Protein A珠子
8. (Bradford 法)做蛋白標準曲線,測定蛋白濃度,測前將總蛋白至少稀釋1:10倍以上,以減少細胞裂解液中去垢劑的影響(定量,分裝后,可以在-20℃保存一個月)
9. 用PBS將總蛋白稀釋到約1 μg/μl,以降低裂解液中去垢劑的濃度,如果興趣蛋白在細胞中含量較低,則總蛋白濃度應該稍高(如10 μg/μl)
10. 加入一定體積的兔抗到500μl總蛋白中,抗體的稀釋比例因興趣蛋白在不同細胞系中的多少而異
11. 4℃緩慢搖動抗原抗體混合物過夜或室溫2h,激酶或磷酸酯酶活性分析建議用2 h室溫孵育
12. 加入100μl Protein A瓊脂糖珠來捕捉抗原抗體復合物,4℃緩慢搖動抗原抗體混合物過夜或室溫1h,如果所用抗體為鼠抗或雞抗,建議加2 μl"過渡抗體"(兔抗鼠IgG,兔抗雞IgG)
13. 14000rpm瞬時離心5s,收集瓊脂糖珠-抗原抗體復合物,去上清,用預冷的RIPA buffer洗3遍,800μl/遍,RIPA buffer有時候會破壞瓊脂糖珠-抗原抗體復合物內(nèi)部的結(jié)合,可以使用PBS
14. 用60μl 2×上樣緩沖液將瓊脂糖珠-抗原抗體復合物懸起,輕輕混勻,緩沖液的量依據(jù)上樣多少的需要而定(60 μl足夠上三道)
15. 將上樣樣品煮5min,以游離抗原,抗體,珠子,離心,將上清電泳,收集剩余瓊脂糖珠,上清也可以暫時凍-20℃,留待以后電泳,電泳前應再次煮5min變性。
三、注意事項:
1)如果是組織樣本,必須當天取當天用,不可放冰箱過夜保存
2)如果是細胞樣本,需提供常溫或4℃狀態(tài)細胞(細胞狀態(tài)良好,數(shù)量不低于10^7)